磷资源中心立足长江经济带、辐射全国、放眼全球，秉承“开放、共享、联合、创新”理念，搭建磷资源高效利用与水环境保护的创新平台。磷资源中心与美国、英国等国际一流校（院）所和中国科学院、中国农业科学院、中国农业大学等10余所国内一流校（院）所建立了全面的交流合作关系。磷资源中心与安徽省科学技术厅、农业农村厅、自然资源厅、生态环境厅等行业主管部门以及安徽六国化工股份有限公司、安徽莱姆佳生物科技股份公司、安徽喜洋洋农业科技有限公司等行业企业建立紧密的产学研合作关系，在人才共育、平台共建、项目共担、成果共享等方面取得可喜成果。

磷资源中心加强与国内外知名高校院所的学术交流。先后承办了“长江经济带磷资源高效利用创新平台成立大会（2018年11月）”、“长江经济带磷资源高效利用与水环境保护学术研讨会（2018年11月）”，“长江经济带磷资源高效利用创新平台第一届理事会暨长江经济带磷资源高效利用与水环境保护研究中心第一届学术委员会会议（2019年4月）”；参加了“农业绿色发展暨全国养分资源管理协作网2019年度学术大会（2019年8月）”、“中国植物营养与肥料学会2019年学术年会（2019年8月）”、“2019世界磷肥和复合肥产业发展大会（2019年8月）”等国内外学术会议10余场次，参加人数超过1000人次。

磷资源中心先后与美国、英国、澳大利亚、德国、荷兰等国际著名大学及科研机构开展了广泛的交流合作，联合承担 “111”引智项目、德国DFG资助的中德玉米磷合作项目、英国牛顿基金会资助的CINAg中英农业氮素利用项目、国家留学基金委资助的荷兰瓦格宁根大学国际合作项目、欧盟第七框架计划及配套科技部合作项目、中澳氮素管理国际合作项目等国际合作项目10余项，邀请国际专家进行学术交流讲座100余人次，学术骨干80多人次应邀在国际会议上做学术报告。